产学研结合办公室是学校产学研工作领导小组的日常工作机构，承担学校产学研工作的组织、协调和服务工作。职能定位如下：

1、协调学校与其它科研院所、大学之间的学术研究合作，配合科技处整合学校科研资源与外单位合作进行国家重大项目的组织申报，重点协调学校与企业合作申报应用型相关的国家重大项目，推进学校与外单位合作重大项目的研究进程，落实学校重大研究成果的目标实现。

2、制订和完善学校产学研结合工作的管理制度，从政策上规范产学研结合各项工作的管理。

3、协调与整合学校中药创新药物与中医诊疗新技术产品开发的研究资源，搭建中药创新药物与中医诊疗新技术产品开发外包服务平台；协调与张江地区外包服务平台的联系；协调学校接受外单位委托项目（横向项目）合作过程，负责横向项目合同的签订和管理；协调与落实学校与企业、科研院所合作研究中心及国际合作研究中心的组建。

4、推进学校科研成果转化，落实学校新产品（包括新药、新医疗产品、新保健品、食品等项目）和知识产权（包括外观专利、新型实用专利、发明专利、国际专利等）转让。

5、协调资产经营公司与学校各部门的关系，推进学校资产经营公司下属对外合作企业的重组和改革，协调学校各部门与外单位在中医医疗、养生保健、教育培训等项目的合作过程，推进项目的落实，协调以学校科研成果为基础的新的合作企业的项目落实过程。

6、负责学校产学研结合信息网建设和维护。